Permainan ini dibangun di sekitar gagasan untuk menciptakan struktur besar menggunakan bola-bola goo. Permainan ini dibagi menjadi lima bab, masing-masing berisi beberapa tingkat. Setiap tingkat memiliki tema sendiri grafis dan musik, memberikan suasana yang unik. Ada juga bonus meta-permainan yang disebut World of Goo Corporation,
di mana tujuannya adalah untuk membangun menara tertinggi menggunakan
bola goo yang pemain dikumpulkan melalui jalannya permainan.
Pemain dari seluruh dunia dapat bersaing, sebagai ketinggian menara dan
jumlah bola goo yang digunakan sedang terus upload ke server 2D Boy.